Protein–RNA interactions for Protein: Q13561

DCTN2, Dynactin subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN2Q13561 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCTN2Q13561 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCTN2Q13561 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCTN2Q13561 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCTN2Q13561 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DCTN2Q13561 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCTN2Q13561 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCTN2Q13561 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DCTN2Q13561 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCTN2Q13561 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCTN2Q13561 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCTN2Q13561 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCTN2Q13561 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCTN2Q13561 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCTN2Q13561 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCTN2Q13561 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCTN2Q13561 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCTN2Q13561 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCTN2Q13561 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms