Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HDAC1Q13547 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
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