Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRQ13535 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRQ13535 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRQ13535 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRQ13535 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRQ13535 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRQ13535 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRQ13535 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRQ13535 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRQ13535 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRQ13535 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRQ13535 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRQ13535 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRQ13535 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRQ13535 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRQ13535 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRQ13535 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRQ13535 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRQ13535 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRQ13535 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRQ13535 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRQ13535 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRQ13535 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRQ13535 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRQ13535 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRQ13535 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRQ13535 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRQ13535 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRQ13535 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRQ13535 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATRQ13535 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATRQ13535 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATRQ13535 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ATRQ13535 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATRQ13535 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATRQ13535 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATRQ13535 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATRQ13535 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATRQ13535 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ATRQ13535 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATRQ13535 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRQ13535 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRQ13535 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRQ13535 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRQ13535 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRQ13535 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRQ13535 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRQ13535 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRQ13535 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRQ13535 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRQ13535 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRQ13535 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRQ13535 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRQ13535 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRQ13535 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRQ13535 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRQ13535 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRQ13535 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRQ13535 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRQ13535 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRQ13535 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRQ13535 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRQ13535 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRQ13535 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRQ13535 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRQ13535 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRQ13535 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRQ13535 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRQ13535 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRQ13535 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRQ13535 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRQ13535 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRQ13535 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRQ13535 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRQ13535 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRQ13535 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRQ13535 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRQ13535 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRQ13535 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRQ13535 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRQ13535 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRQ13535 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRQ13535 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRQ13535 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRQ13535 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRQ13535 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRQ13535 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRQ13535 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRQ13535 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRQ13535 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRQ13535 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRQ13535 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRQ13535 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRQ13535 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRQ13535 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRQ13535 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRQ13535 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRQ13535 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRQ13535 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRQ13535 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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