Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRSF5Q13243 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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