Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC35.19■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC35.18■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC35.16■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC35.14■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.22
GRIN2BQ13224 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
GRIN2BQ13224 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
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