Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 CNOT4-208ENST00000465721 556 ntTSL 412.23□□□□□ -0.458e-8■■■■□ 26.5
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TARDBPQ13148 CNOT4-210ENST00000491203 538 ntTSL 48.11□□□□□ -1.118e-8■■■■□ 26.5
TARDBPQ13148 JMJD1C-207ENST00000489372 913 ntTSL 57.48□□□□□ -1.218e-8■■■■□ 26.5
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TARDBPQ13148 JMJD1C-205ENST00000469152 734 ntTSL 36.15□□□□□ -1.428e-8■■■■□ 26.5
TARDBPQ13148 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.918e-8■■■■□ 26.5
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TARDBPQ13148 ZFPM2-204ENST00000518180 596 ntTSL 44.79□□□□□ -1.642e-7■■■■□ 26.5
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TARDBPQ13148 GRB10-204ENST00000398812 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.964e-7■■■■□ 26.5
TARDBPQ13148 GRB10-207ENST00000402578 4760 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.094e-7■■■■□ 26.5
TARDBPQ13148 MON2-208ENST00000549378 1689 ntTSL 1 (best)19.2■□□□□ 0.669e-8■■■■□ 26.5
TARDBPQ13148 MON2-205ENST00000547095 5708 ntTSL 1 (best)16.48■□□□□ 0.239e-8■■■■□ 26.5
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TARDBPQ13148 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.149e-8■■■■□ 26.5
TARDBPQ13148 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.139e-8■■■■□ 26.5
TARDBPQ13148 MON2-207ENST00000549286 424 ntTSL 512.74□□□□□ -0.379e-8■■■■□ 26.5
TARDBPQ13148 MON2-212ENST00000552115 3760 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.539e-8■■■■□ 26.5
TARDBPQ13148 MON2-214ENST00000641654 10382 ntBASIC10.53□□□□□ -0.729e-8■■■■□ 26.5
TARDBPQ13148 MON2-202ENST00000393630 13275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.139e-8■■■■□ 26.5
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TARDBPQ13148 TRPM7-202ENST00000558444 465 ntTSL 35.23□□□□□ -1.579e-8■■■■□ 26.5
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TARDBPQ13148 ST6GAL1-212ENST00000448408 1005 ntTSL 59.88□□□□□ -0.836e-10■■■■□ 26.5
TARDBPQ13148 ST6GAL1-208ENST00000440338 568 ntTSL 45.14□□□□□ -1.596e-10■■■■□ 26.5
TARDBPQ13148 ST6GAL1-202ENST00000416235 577 ntTSL 24.88□□□□□ -1.636e-10■■■■□ 26.5
TARDBPQ13148 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.373e-7■■■■□ 26.5
TARDBPQ13148 AC069277.1-201ENST00000433639 1083 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.432e-7■■■■□ 26.5
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TARDBPQ13148 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.364e-7■■■■□ 26.5
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TARDBPQ13148 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.543e-8■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.513e-8■■■■□ 26.4
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TARDBPQ13148 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.313e-8■■■■□ 26.4
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TARDBPQ13148 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.013e-8■■■■□ 26.4
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TARDBPQ13148 ZNF7-213ENST00000532051 540 ntTSL 414.92□□□□□ -0.023e-8■■■■□ 26.4
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TARDBPQ13148 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.173e-8■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.173e-8■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 CPEB1-202ENST00000566716 502 ntTSL 313.83□□□□□ -0.23e-8■■■■□ 26.4
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TARDBPQ13148 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.213e-8■■■■□ 26.4
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TARDBPQ13148 CPEB1-201ENST00000563519 536 ntTSL 413.02□□□□□ -0.333e-8■■■■□ 26.4
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TARDBPQ13148 ZNF7-204ENST00000527218 545 ntTSL 412.68□□□□□ -0.383e-8■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 DDX17-201ENST00000216019 6441 ntTSL 1 (best)12.66□□□□□ -0.383e-8■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 ZNF7-217ENST00000533314 516 ntTSL 412.63□□□□□ -0.393e-8■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.393e-8■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.43e-8■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 ZNF7-209ENST00000529819 513 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.473e-8■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 AL645568.1-201ENST00000367716 1815 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.663e-8■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 BCAT1-205ENST00000539282 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.663e-8■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 SPTBN2-211ENST00000617502 3498 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.673e-8■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 DDX17-205ENST00000432525 1354 ntTSL 210.47□□□□□ -0.733e-8■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 ZNF7-205ENST00000528017 5641 ntTSL 1 (best)10.05□□□□□ -0.83e-8■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 BCAT1-204ENST00000538118 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.823e-8■■■■□ 26.4
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TARDBPQ13148 ZNF7-215ENST00000532393 569 ntTSL 49.02□□□□□ -0.973e-8■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 STK3-205ENST00000518582 725 ntTSL 38.89□□□□□ -0.993e-8■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 NIPBL-202ENST00000448238 8729 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.013e-8■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 NIPBL-201ENST00000282516 10435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.033e-8■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 RNF24-203ENST00000432261 3149 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.13e-8■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 ZBTB44-207ENST00000528448 539 ntTSL 47.92□□□□□ -1.143e-8■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 STK3-204ENST00000518165 817 ntTSL 1 (best)7.91□□□□□ -1.143e-8■■■■□ 26.4
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