Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BNIP3Q12983 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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