Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXF2Q12947 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXF2Q12947 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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