Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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