Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
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