Protein–RNA interactions for Protein: Q12378

RTR2, RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RTR2, yeastyeast

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTR2Q12378 YJL211CYJL211C 444 nt2.29□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 HHF2YNL030W 312 nt2.29□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 RPL1AYPL220W 654 nt2.29□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 YBR209WYBR209W 318 nt2.29□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 RIX1YHR197W 2292 nt2.29□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 SWR1YDR334W 4545 nt2.29□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 HBT1YDL223C 3141 nt2.28□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 VPS3YDR495C 3036 nt2.28□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 YHR078WYHR078W 1659 nt2.28□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 BUB1YGR188C 3066 nt2.28□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 PDS1YDR113C 1122 nt2.28□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt2.28□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 PEX4YGR133W 552 nt2.28□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.28□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 YLR339CYLR339C 552 nt2.28□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 RAS1YOR101W 930 nt2.28□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 TRS130YMR218C 3309 nt2.28□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 SLP1YOR154W 1764 nt2.28□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 DUN1YDL101C 1542 nt2.27□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 KRE33YNL132W 3171 nt2.27□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 BUR6YER159C 429 nt2.27□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 YJR020WYJR020W 333 nt2.27□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 YLR416CYLR416C 399 nt2.27□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 ARF3YOR094W 552 nt2.27□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 TCM62YBR044C 1719 nt2.27□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.27□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.27□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.27□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.27□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 YER138CYER138C 5268 nt2.27□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 YER160CYER160C 5268 nt2.27□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.27□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.27□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 YJR027WYJR027W 5268 nt2.27□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.27□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 YML039WYML039W 5268 nt2.27□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 YML045WYML045W 5268 nt2.27□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 YMR050CYMR050C 5268 nt2.27□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.27□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.27□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.27□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.27□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.27□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 CUE3YGL110C 1875 nt2.26□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 TPS2YDR074W 2691 nt2.26□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 YJL181WYJL181W 1836 nt2.26□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 NPL4YBR170C 1743 nt2.26□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 YKR011CYKR011C 1062 nt2.26□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 RPN4YDL020C 1596 nt2.26□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 FAR11YNL127W 2862 nt2.26□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 RLI1YDR091C 1827 nt2.26□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 MRP10YDL045W-A 288 nt2.25□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 RLP7YNL002C 969 nt2.25□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 AYT1YLL063C 1425 nt2.25□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 CTM1YHR109W 1758 nt2.24□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 DNA2YHR164C 4569 nt2.24□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 RPS29BYDL061C 171 nt2.24□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 INO2YDR123C 915 nt2.24□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 SAW1YAL027W 786 nt2.24□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 IME1YJR094C 1083 nt2.24□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 INP1YMR204C 1263 nt2.24□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 RPL25YOL127W 429 nt2.24□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 YOR055WYOR055W 435 nt2.24□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.23□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 YIL054WYIL054W 318 nt2.23□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 YPR053CYPR053C 456 nt2.23□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 CBP6YBR120C 489 nt2.23□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 RGR1YLR071C 3249 nt2.23□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 FKS3YMR306W 5358 nt2.23□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 YPL150WYPL150W 2706 nt2.23□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 HAA1YPR008W 2085 nt2.22□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 IRC8YJL051W 2469 nt2.22□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 MPC3YGR243W 441 nt2.22□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 RPS29AYLR388W 171 nt2.22□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 YOR097CYOR097C 528 nt2.22□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 NME1NME1 340 nt2.22□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 HAT1YPL001W 1125 nt2.22□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 DBP5YOR046C 1449 nt2.22□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 DIA2YOR080W 2199 nt2.22□□□□□ -2.05
RTR2Q12378 DXO1YDR370C 1329 nt2.21□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 YCR101CYCR101C 549 nt2.21□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 MCD1YDL003W 1701 nt2.21□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 RPL27BYDR471W 411 nt2.21□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 PRE1YER012W 597 nt2.21□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 SMX2YFL017W-A 234 nt2.21□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 YHR137C-AYHR137C-A 651 nt2.21□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 CYC2YOR037W 1101 nt2.21□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 ALG8YOR067C 1734 nt2.21□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 HHF1YBR009C 312 nt2.21□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.21□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 snR43snR43 209 nt2.21□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.2□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 SPH1YLR313C 1593 nt2.2□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 YEL057CYEL057C 702 nt2.2□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 YBL108WYBL108W 306 nt2.2□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 YOL166CYOL166C 339 nt2.2□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 YOR387CYOR387C 621 nt2.2□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 SUL1YBR294W 2580 nt2.2□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 YKL075CYKL075C 1353 nt2.2□□□□□ -2.06
RTR2Q12378 DSN1YIR010W 1731 nt2.2□□□□□ -2.06
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