Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 YGR126WYGR126W 693 nt4.29□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 YGR290WYGR290W 444 nt4.29□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt4.29□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 YAL034C-BYAL034C-B 354 nt4.29□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 ECI1YLR284C 843 nt4.29□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt4.29□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 RPL18AYOL120C 561 nt4.29□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 BUD21YOR078W 645 nt4.29□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 PET123YOR158W 957 nt4.29□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 CAF20YOR276W 486 nt4.29□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 RFC5YBR087W 1065 nt4.29□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 SPT16YGL207W 3108 nt4.29□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 FLO10YKR102W 3510 nt4.29□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 CIT1YNR001C 1440 nt4.29□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 PTA1YAL043C 2358 nt4.28□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 RPS25AYGR027C 327 nt4.28□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 YJR112W-AYJR112W-A 330 nt4.28□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 GIM5YML094W 492 nt4.28□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 DDP1YOR163W 567 nt4.28□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt4.28□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 CTP1YBR291C 900 nt4.28□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 SRO7YPR032W 3102 nt4.28□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 TRM82YDR165W 1335 nt4.27□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 CDC14YFR028C 1656 nt4.27□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 GMC2YLR445W 567 nt4.27□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 SIL1YOL031C 1266 nt4.27□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 YOR387CYOR387C 621 nt4.27□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 MRPL51YPR100W 423 nt4.27□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 SCD6YPR129W 1050 nt4.27□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 YBR242WYBR242W 717 nt4.27□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 NUP85YJR042W 2235 nt4.27□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 CTM1YHR109W 1758 nt4.27□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 UBX5YDR330W 1503 nt4.26□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 ROD1YOR018W 2514 nt4.26□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 ERG5YMR015C 1617 nt4.26□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 AAD3YCR107W 1092 nt4.26□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 DTD1YDL219W 453 nt4.26□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 PHM6YDR281C 315 nt4.26□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 FCF1YDR339C 570 nt4.26□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 RPS18AYDR450W 441 nt4.26□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 DIG2YDR480W 972 nt4.26□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 YPT35YHR105W 645 nt4.26□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 REC104YHR157W 549 nt4.26□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 YJR141WYJR141W 1044 nt4.26□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 CCE1YKL011C 1062 nt4.26□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 COX19YLL018C-A 297 nt4.26□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 TPM1YNL079C 600 nt4.26□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 YSF3YNL138W-A 258 nt4.26□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 YOR365CYOR365C 2112 nt4.26□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 AGE1YDR524C 1449 nt4.26□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 ULP1YPL020C 1866 nt4.26□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 SWI1YPL016W 3945 nt4.26□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 SYT1YPR095C 3681 nt4.25□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 TGL2YDR058C 981 nt4.25□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 KEI1YDR367W 666 nt4.25□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 YGR160WYGR160W 612 nt4.25□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 MRPL9YGR220C 810 nt4.25□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 LIN1YHR156C 1023 nt4.25□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 HCA4YJL033W 2313 nt4.25□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 COQ5YML110C 924 nt4.25□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 YMR310CYMR310C 954 nt4.25□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 OAF3YKR064W 2592 nt4.24□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 REB1YBR049C 2433 nt4.24□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 PGS1YCL004W 1566 nt4.24□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 MNL1YHR204W 2391 nt4.24□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 YDR355CYDR355C 303 nt4.24□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 YER076CYER076C 909 nt4.24□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt4.24□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 PRM6YML047C 1059 nt4.24□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 HNT3YOR258W 654 nt4.24□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 RSA1YPL193W 1146 nt4.24□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 PIN3YPR154W 648 nt4.24□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 POL30YBR088C 777 nt4.24□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 IMH1YLR309C 2736 nt4.24□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 SPR3YGR059W 1539 nt4.24□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 DAP2YHR028C 2457 nt4.23□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 SPH1YLR313C 1593 nt4.23□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 SEC59YMR013C 1560 nt4.23□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 MSS4YDR208W 2340 nt4.23□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 GPI13YLL031C 3054 nt4.23□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 SRP72YPL210C 1923 nt4.23□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 MRH4YGL064C 1686 nt4.23□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 FAT1YBR041W 2010 nt4.23□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 BSC1YDL037C 987 nt4.23□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 TAD1YGL243W 1203 nt4.23□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 PDX1YGR193C 1233 nt4.23□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 ATG27YJL178C 816 nt4.23□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 SDS22YKL193C 1017 nt4.23□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 RPN13YLR421C 471 nt4.23□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 YPR078CYPR078C 1119 nt4.23□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 YPR148CYPR148C 1308 nt4.22□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 SLA1YBL007C 3735 nt4.22□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 YGR117CYGR117C 1431 nt4.22□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 RIM1YCR028C-A 408 nt4.22□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt4.22□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 BI2Q0110 1272 nt4.22□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 TAN1YGL232W 870 nt4.22□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 YGR018CYGR018C 330 nt4.22□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 ECM13YBL043W 774 nt4.22□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 YBL055CYBL055C 1257 nt4.22□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 45.8 ms