Protein–RNA interactions for Protein: Q12098

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, yeastyeast

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLX4Q12098 YBR225WYBR225W 2703 nt4.12□□□□□ -1.75
SLX4Q12098 NGG1YDR176W 2109 nt4.12□□□□□ -1.75
SLX4Q12098 CWC2YDL209C 1020 nt4.12□□□□□ -1.75
SLX4Q12098 NKP1YDR383C 717 nt4.12□□□□□ -1.75
SLX4Q12098 MAM1YER106W 909 nt4.12□□□□□ -1.75
SLX4Q12098 YGR226CYGR226C 210 nt4.12□□□□□ -1.75
SLX4Q12098 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt4.12□□□□□ -1.75
SLX4Q12098 ECM9YKR004C 1134 nt4.12□□□□□ -1.75
SLX4Q12098 FLD1YLR404W 858 nt4.12□□□□□ -1.75
SLX4Q12098 YNR062CYNR062C 984 nt4.12□□□□□ -1.75
SLX4Q12098 POP7YBR167C 423 nt4.12□□□□□ -1.75
SLX4Q12098 MTC4YBR255W 2085 nt4.12□□□□□ -1.75
SLX4Q12098 HTA1YDR225W 399 nt4.11□□□□□ -1.75
SLX4Q12098 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt4.11□□□□□ -1.75
SLX4Q12098 YEL075CYEL075C 369 nt4.11□□□□□ -1.75
SLX4Q12098 YGL109WYGL109W 324 nt4.11□□□□□ -1.75
SLX4Q12098 MBR1YKL093W 1020 nt4.11□□□□□ -1.75
SLX4Q12098 SYT1YPR095C 3681 nt4.11□□□□□ -1.75
SLX4Q12098 TMA108YIL137C 2841 nt4.11□□□□□ -1.75
SLX4Q12098 LOS1YKL205W 3303 nt4.11□□□□□ -1.75
SLX4Q12098 RPB2YOR151C 3675 nt4.1□□□□□ -1.75
SLX4Q12098 SWI1YPL016W 3945 nt4.1□□□□□ -1.75
SLX4Q12098 PSP1YDR505C 2526 nt4.1□□□□□ -1.75
SLX4Q12098 GRX2YDR513W 432 nt4.1□□□□□ -1.75
SLX4Q12098 YCL007CYCL007C 393 nt4.1□□□□□ -1.75
SLX4Q12098 RAD18YCR066W 1464 nt4.1□□□□□ -1.75
SLX4Q12098 CHK1YBR274W 1584 nt4.1□□□□□ -1.75
SLX4Q12098 PIG2YIL045W 1617 nt4.1□□□□□ -1.75
SLX4Q12098 HRD1YOL013C 1656 nt4.1□□□□□ -1.75
SLX4Q12098 ARG2YJL071W 1725 nt4.09□□□□□ -1.75
SLX4Q12098 TOP1YOL006C 2310 nt4.09□□□□□ -1.75
SLX4Q12098 ERP3YDL018C 678 nt4.09□□□□□ -1.75
SLX4Q12098 YDR149CYDR149C 708 nt4.09□□□□□ -1.75
SLX4Q12098 MFA1YDR461W 111 nt4.09□□□□□ -1.75
SLX4Q12098 PGD1YGL025C 1194 nt4.09□□□□□ -1.75
SLX4Q12098 NNT1YLR285W 786 nt4.09□□□□□ -1.75
SLX4Q12098 KAR4YCL055W 1008 nt4.09□□□□□ -1.75
SLX4Q12098 CST9YLR394W 1449 nt4.09□□□□□ -1.75
SLX4Q12098 ARO80YDR421W 2853 nt4.09□□□□□ -1.75
SLX4Q12098 CDC37YDR168W 1521 nt4.09□□□□□ -1.75
SLX4Q12098 REF2YDR195W 1602 nt4.09□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 XRS2YDR369C 2565 nt4.08□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 SEC4YFL005W 648 nt4.08□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 LST7YGR057C 729 nt4.08□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 YLR416CYLR416C 399 nt4.08□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 ERG2YMR202W 669 nt4.08□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 ESA1YOR244W 1338 nt4.08□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 YBR090CYBR090C 369 nt4.08□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 MCM7YBR202W 2538 nt4.08□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 IRC3YDR332W 2070 nt4.07□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 ATP25YMR098C 1839 nt4.07□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 RPO21YDL140C 5202 nt4.07□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 CCM1YGR150C 2595 nt4.07□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 ARF1YDL192W 546 nt4.07□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 YPD1YDL235C 504 nt4.07□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 YER158W-AYER158W-A 216 nt4.07□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt4.07□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt4.07□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 MRPL9YGR220C 810 nt4.07□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 RPA12YJR063W 378 nt4.07□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 YPT52YKR014C 705 nt4.07□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 NRK1YNL129W 723 nt4.07□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 ASI2YNL159C 870 nt4.07□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 IZH2YOL002C 954 nt4.07□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 HHF1YBR009C 312 nt4.07□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt4.07□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 REB1YBR049C 2433 nt4.07□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 APC5YOR249C 2058 nt4.07□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 CLB3YDL155W 1284 nt4.06□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 YDR248CYDR248C 582 nt4.06□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 TAD1YGL243W 1203 nt4.06□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 YLR050CYLR050C 486 nt4.06□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 IDP2YLR174W 1239 nt4.06□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 HMX1YLR205C 954 nt4.06□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 YBR053CYBR053C 1077 nt4.06□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 YBR063CYBR063C 1215 nt4.06□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 SRP1YNL189W 1629 nt4.06□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 GAC1YOR178C 2382 nt4.05□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 RNR1YER070W 2667 nt4.05□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 HMO1YDR174W 741 nt4.05□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 RMD6YEL072W 696 nt4.05□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 COBQ0105 1158 nt4.05□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 RPL1BYGL135W 654 nt4.05□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 BRR6YGL247W 594 nt4.05□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 UPF3YGR072W 1164 nt4.05□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 PRP38YGR075C 729 nt4.05□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 IME1YJR094C 1083 nt4.05□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 YKL115CYKL115C 393 nt4.05□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 ATG38YLR211C 681 nt4.05□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 YLR400WYLR400W 474 nt4.05□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 YNL013CYNL013C 378 nt4.05□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 MCA1YOR197W 1299 nt4.05□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 RPL1AYPL220W 654 nt4.05□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 FYV5YCL058C 459 nt4.05□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 VPS17YOR132W 1656 nt4.05□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 AIP1YMR092C 1848 nt4.05□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 YBP2YGL060W 1926 nt4.04□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 YGR160WYGR160W 612 nt4.04□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 GEP4YHR100C 558 nt4.04□□□□□ -1.76
SLX4Q12098 LIN1YHR156C 1023 nt4.04□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.1 ms