Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms