Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM27E3Q08E93 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM27E3Q08E93 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms