Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CD47Q08722 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CD47Q08722 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CD47Q08722 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CD47Q08722 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CD47Q08722 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CD47Q08722 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CD47Q08722 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CD47Q08722 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CD47Q08722 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CD47Q08722 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CD47Q08722 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CD47Q08722 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CD47Q08722 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CD47Q08722 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CD47Q08722 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CD47Q08722 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CD47Q08722 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CD47Q08722 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CD47Q08722 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CD47Q08722 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD47Q08722 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD47Q08722 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD47Q08722 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD47Q08722 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD47Q08722 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD47Q08722 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD47Q08722 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD47Q08722 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD47Q08722 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CD47Q08722 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CD47Q08722 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CD47Q08722 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD47Q08722 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD47Q08722 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD47Q08722 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD47Q08722 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD47Q08722 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD47Q08722 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD47Q08722 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD47Q08722 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD47Q08722 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD47Q08722 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD47Q08722 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD47Q08722 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD47Q08722 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD47Q08722 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD47Q08722 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD47Q08722 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD47Q08722 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD47Q08722 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD47Q08722 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD47Q08722 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD47Q08722 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD47Q08722 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD47Q08722 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD47Q08722 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD47Q08722 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD47Q08722 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD47Q08722 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD47Q08722 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD47Q08722 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD47Q08722 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD47Q08722 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD47Q08722 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD47Q08722 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD47Q08722 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD47Q08722 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD47Q08722 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD47Q08722 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD47Q08722 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD47Q08722 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD47Q08722 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD47Q08722 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD47Q08722 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD47Q08722 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD47Q08722 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD47Q08722 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD47Q08722 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD47Q08722 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD47Q08722 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD47Q08722 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD47Q08722 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD47Q08722 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD47Q08722 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD47Q08722 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CD47Q08722 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CD47Q08722 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CD47Q08722 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CD47Q08722 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CD47Q08722 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CD47Q08722 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CD47Q08722 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CD47Q08722 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CD47Q08722 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CD47Q08722 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CD47Q08722 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CD47Q08722 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CD47Q08722 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CD47Q08722 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms