Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
DSC1Q08554 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSC1Q08554 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms