Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms