Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PPP3CAQ08209 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms