Protein–RNA interactions for Protein: Q07912

TNK2, Activated CDC42 kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNK2Q07912 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNK2Q07912 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms