Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4BQ07343 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms