Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL16A1Q07092 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms