Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 RPS29BYDL061C 171 nt3.37□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 YDR133CYDR133C 336 nt3.37□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 HMO1YDR174W 741 nt3.37□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 YDR248CYDR248C 582 nt3.37□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 PHM6YDR281C 315 nt3.37□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 DAL2YIR029W 1032 nt3.37□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 ATG38YLR211C 681 nt3.37□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 YMR087WYMR087W 855 nt3.37□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 DDP1YOR163W 567 nt3.37□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 DGA1YOR245C 1257 nt3.37□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 YPR136CYPR136C 513 nt3.37□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 RXT2YBR095C 1293 nt3.37□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 snR24snR24 89 nt3.37□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 CDC37YDR168W 1521 nt3.37□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 HUL5YGL141W 2733 nt3.37□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 MTR4YJL050W 3222 nt3.37□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 YNL011CYNL011C 1335 nt3.37□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 PIG2YIL045W 1617 nt3.37□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 NTA1YJR062C 1374 nt3.37□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 USA1YML029W 2517 nt3.36□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 ATG21YPL100W 1491 nt3.36□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 SIN4YNL236W 2925 nt3.36□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 AHA1YDR214W 1053 nt3.36□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 RMD6YEL072W 696 nt3.36□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 RSM18YER050C 417 nt3.36□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 YHR032C-AYHR032C-A 120 nt3.36□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 LIN1YHR156C 1023 nt3.36□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 YHR180WYHR180W 492 nt3.36□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 SNX4YJL036W 1272 nt3.36□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt3.36□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 snR17asnR17a 333 nt3.36□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 HUT1YPL244C 1020 nt3.36□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 RPL19AYBR084C-A 570 nt3.36□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 PGS1YCL004W 1566 nt3.36□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 STU1YBL034C 4542 nt3.36□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt3.36□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 PPQ1YPL179W 1650 nt3.36□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 AGE1YDR524C 1449 nt3.36□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 THR4YCR053W 1545 nt3.35□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 TAF1YGR274C 3201 nt3.35□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 KAP95YLR347C 2586 nt3.35□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 SEC27YGL137W 2670 nt3.35□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 ERG5YMR015C 1617 nt3.35□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 RIM1YCR028C-A 408 nt3.35□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 RRP42YDL111C 798 nt3.35□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 ECM11YDR446W 909 nt3.35□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 SEC4YFL005W 648 nt3.35□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 CKA1YIL035C 1119 nt3.35□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 RGI2YIL057C 495 nt3.35□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 EMC2YJR088C 879 nt3.35□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 YOR387CYOR387C 621 nt3.35□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 SNF8YPL002C 702 nt3.35□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 YJL049WYJL049W 1353 nt3.35□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 LTV1YKL143W 1392 nt3.35□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 NOP56YLR197W 1515 nt3.34□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 YDL199CYDL199C 2064 nt3.34□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 TRX3YCR083W 384 nt3.34□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 YGR160WYGR160W 612 nt3.34□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 YHL026CYHL026C 948 nt3.34□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt3.34□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 YHR097CYHR097C 1101 nt3.34□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 PEX18YHR160C 852 nt3.34□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 YJR020WYJR020W 333 nt3.34□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 NNF1YJR112W 606 nt3.34□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 SGT1YOR057W 1188 nt3.34□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 CWH43YCR017C 2862 nt3.34□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 TSR1YDL060W 2367 nt3.34□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 PRM15YMR278W 1869 nt3.34□□□□□ -1.87
SSK1Q07084 ERB1YMR049C 2424 nt3.33□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 PEX1YKL197C 3132 nt3.33□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 ALA1YOR335C 2877 nt3.33□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 LRS4YDR439W 1044 nt3.33□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 SNO3YFL060C 669 nt3.33□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt3.33□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 COG2YGR120C 789 nt3.33□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 RPL27AYHR010W 411 nt3.33□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 FUR1YHR128W 651 nt3.33□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 YNL276CYNL276C 396 nt3.33□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 SNO2YNL334C 669 nt3.33□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt3.33□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 YMR046CYMR046C 1323 nt3.33□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 BUD27YFL023W 2391 nt3.33□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 CST9YLR394W 1449 nt3.33□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 YML096WYML096W 1578 nt3.33□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 YPD1YDL235C 504 nt3.32□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 RAV2YDR202C 1056 nt3.32□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt3.32□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 MND1YGL183C 660 nt3.32□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 SPT4YGR063C 309 nt3.32□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 IGO2YHR132W-A 396 nt3.32□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 YJR111CYJR111C 852 nt3.32□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 COQ9YLR201C 783 nt3.32□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 RNT1YMR239C 1416 nt3.32□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 ASI1YMR119W 1875 nt3.32□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 NOG1YPL093W 1944 nt3.32□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 RNR1YER070W 2667 nt3.32□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 POL1YNL102W 4407 nt3.32□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 ZDS2YML109W 2829 nt3.31□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 MRH4YGL064C 1686 nt3.31□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 SUC2YIL162W 1599 nt3.31□□□□□ -1.88
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