Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms