Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LTBQ06643 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LTBQ06643 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LTBQ06643 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LTBQ06643 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LTBQ06643 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LTBQ06643 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LTBQ06643 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LTBQ06643 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LTBQ06643 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LTBQ06643 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LTBQ06643 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LTBQ06643 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LTBQ06643 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LTBQ06643 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LTBQ06643 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LTBQ06643 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LTBQ06643 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LTBQ06643 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LTBQ06643 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LTBQ06643 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LTBQ06643 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LTBQ06643 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LTBQ06643 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LTBQ06643 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LTBQ06643 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LTBQ06643 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LTBQ06643 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LTBQ06643 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LTBQ06643 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LTBQ06643 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LTBQ06643 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LTBQ06643 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LTBQ06643 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LTBQ06643 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LTBQ06643 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LTBQ06643 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LTBQ06643 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LTBQ06643 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LTBQ06643 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LTBQ06643 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LTBQ06643 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LTBQ06643 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LTBQ06643 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LTBQ06643 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LTBQ06643 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LTBQ06643 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LTBQ06643 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LTBQ06643 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LTBQ06643 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LTBQ06643 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LTBQ06643 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LTBQ06643 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LTBQ06643 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LTBQ06643 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LTBQ06643 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LTBQ06643 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LTBQ06643 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LTBQ06643 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
LTBQ06643 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LTBQ06643 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LTBQ06643 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LTBQ06643 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LTBQ06643 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LTBQ06643 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LTBQ06643 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
LTBQ06643 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LTBQ06643 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LTBQ06643 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LTBQ06643 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LTBQ06643 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LTBQ06643 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LTBQ06643 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LTBQ06643 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LTBQ06643 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LTBQ06643 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LTBQ06643 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LTBQ06643 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LTBQ06643 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LTBQ06643 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LTBQ06643 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LTBQ06643 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LTBQ06643 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LTBQ06643 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LTBQ06643 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LTBQ06643 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LTBQ06643 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LTBQ06643 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LTBQ06643 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LTBQ06643 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LTBQ06643 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LTBQ06643 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LTBQ06643 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LTBQ06643 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LTBQ06643 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LTBQ06643 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LTBQ06643 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LTBQ06643 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LTBQ06643 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LTBQ06643 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms