Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABPB1Q06547 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms