Protein–RNA interactions for Protein: Q05397

PTK2, Focal adhesion kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2Q05397 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTK2Q05397 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms