Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPN12Q05209 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms