Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms