Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYP4A11Q02928 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYP4A11Q02928 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYP4A11Q02928 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYP4A11Q02928 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYP4A11Q02928 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYP4A11Q02928 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYP4A11Q02928 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYP4A11Q02928 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYP4A11Q02928 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYP4A11Q02928 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYP4A11Q02928 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYP4A11Q02928 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYP4A11Q02928 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYP4A11Q02928 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYP4A11Q02928 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYP4A11Q02928 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYP4A11Q02928 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYP4A11Q02928 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYP4A11Q02928 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYP4A11Q02928 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYP4A11Q02928 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYP4A11Q02928 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYP4A11Q02928 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CYP4A11Q02928 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYP4A11Q02928 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYP4A11Q02928 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYP4A11Q02928 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYP4A11Q02928 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYP4A11Q02928 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYP4A11Q02928 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYP4A11Q02928 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYP4A11Q02928 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYP4A11Q02928 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYP4A11Q02928 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CYP4A11Q02928 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYP4A11Q02928 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYP4A11Q02928 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYP4A11Q02928 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CYP4A11Q02928 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYP4A11Q02928 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYP4A11Q02928 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYP4A11Q02928 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYP4A11Q02928 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYP4A11Q02928 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYP4A11Q02928 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYP4A11Q02928 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYP4A11Q02928 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CYP4A11Q02928 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYP4A11Q02928 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYP4A11Q02928 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYP4A11Q02928 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYP4A11Q02928 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP4A11Q02928 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms