Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PLOD1Q02809 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms