Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 AC098483.1-201ENST00000438623 955 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 RNF139-AS1-202ENST00000519861 359 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 SPATA45-201ENST00000332912 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 AC027281.2-201ENST00000623856 713 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 AL139353.2-202ENST00000502430 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 AC083964.1-201ENST00000607549 630 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNB1Q02641 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms