Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
OC90Q02509 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
OC90Q02509 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
OC90Q02509 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
OC90Q02509 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
OC90Q02509 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
OC90Q02509 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
OC90Q02509 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
OC90Q02509 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
OC90Q02509 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
OC90Q02509 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
OC90Q02509 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
OC90Q02509 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
OC90Q02509 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
OC90Q02509 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
OC90Q02509 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
OC90Q02509 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
OC90Q02509 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
OC90Q02509 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
OC90Q02509 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
OC90Q02509 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
OC90Q02509 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
OC90Q02509 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
OC90Q02509 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
OC90Q02509 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
OC90Q02509 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
OC90Q02509 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
OC90Q02509 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
OC90Q02509 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
OC90Q02509 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
OC90Q02509 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
OC90Q02509 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
OC90Q02509 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
OC90Q02509 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
OC90Q02509 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
OC90Q02509 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
OC90Q02509 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
OC90Q02509 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
OC90Q02509 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
OC90Q02509 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
OC90Q02509 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
OC90Q02509 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
OC90Q02509 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
OC90Q02509 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
OC90Q02509 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
OC90Q02509 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
OC90Q02509 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
OC90Q02509 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
OC90Q02509 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
OC90Q02509 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
OC90Q02509 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
OC90Q02509 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
OC90Q02509 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
OC90Q02509 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
OC90Q02509 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
OC90Q02509 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
OC90Q02509 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
OC90Q02509 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
OC90Q02509 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
OC90Q02509 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.74
OC90Q02509 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
OC90Q02509 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
OC90Q02509 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
OC90Q02509 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
OC90Q02509 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
OC90Q02509 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
OC90Q02509 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
OC90Q02509 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
OC90Q02509 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
OC90Q02509 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
OC90Q02509 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
OC90Q02509 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
OC90Q02509 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
OC90Q02509 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
OC90Q02509 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
OC90Q02509 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
OC90Q02509 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
OC90Q02509 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
OC90Q02509 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
OC90Q02509 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
OC90Q02509 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
OC90Q02509 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
OC90Q02509 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
OC90Q02509 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
OC90Q02509 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
OC90Q02509 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
OC90Q02509 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
OC90Q02509 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
OC90Q02509 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
OC90Q02509 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
OC90Q02509 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
OC90Q02509 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
OC90Q02509 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
OC90Q02509 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
OC90Q02509 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
OC90Q02509 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
OC90Q02509 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
OC90Q02509 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
OC90Q02509 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
OC90Q02509 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms