Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DSG1Q02413 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms