Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms