Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
TNFRSF17Q02223 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF17Q02223 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms