Protein–RNA interactions for Protein: Q02127

DHODH, Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHODHQ02127 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DHODHQ02127 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DHODHQ02127 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DHODHQ02127 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DHODHQ02127 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DHODHQ02127 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DHODHQ02127 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DHODHQ02127 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DHODHQ02127 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DHODHQ02127 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DHODHQ02127 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DHODHQ02127 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DHODHQ02127 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DHODHQ02127 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DHODHQ02127 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DHODHQ02127 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DHODHQ02127 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DHODHQ02127 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DHODHQ02127 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DHODHQ02127 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DHODHQ02127 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DHODHQ02127 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DHODHQ02127 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DHODHQ02127 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DHODHQ02127 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DHODHQ02127 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DHODHQ02127 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DHODHQ02127 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DHODHQ02127 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DHODHQ02127 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DHODHQ02127 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DHODHQ02127 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DHODHQ02127 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DHODHQ02127 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DHODHQ02127 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DHODHQ02127 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DHODHQ02127 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DHODHQ02127 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DHODHQ02127 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DHODHQ02127 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DHODHQ02127 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DHODHQ02127 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DHODHQ02127 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DHODHQ02127 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DHODHQ02127 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DHODHQ02127 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DHODHQ02127 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DHODHQ02127 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DHODHQ02127 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DHODHQ02127 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DHODHQ02127 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DHODHQ02127 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DHODHQ02127 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DHODHQ02127 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DHODHQ02127 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DHODHQ02127 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DHODHQ02127 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DHODHQ02127 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DHODHQ02127 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DHODHQ02127 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DHODHQ02127 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DHODHQ02127 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DHODHQ02127 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DHODHQ02127 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DHODHQ02127 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DHODHQ02127 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DHODHQ02127 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DHODHQ02127 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DHODHQ02127 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DHODHQ02127 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DHODHQ02127 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DHODHQ02127 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DHODHQ02127 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DHODHQ02127 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DHODHQ02127 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DHODHQ02127 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DHODHQ02127 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DHODHQ02127 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DHODHQ02127 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DHODHQ02127 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DHODHQ02127 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DHODHQ02127 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DHODHQ02127 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DHODHQ02127 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DHODHQ02127 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DHODHQ02127 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DHODHQ02127 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DHODHQ02127 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DHODHQ02127 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DHODHQ02127 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DHODHQ02127 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DHODHQ02127 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DHODHQ02127 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DHODHQ02127 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DHODHQ02127 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DHODHQ02127 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DHODHQ02127 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DHODHQ02127 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DHODHQ02127 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DHODHQ02127 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms