Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms