Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC42EP1Q00587 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms