Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms