Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CDK3Q00526 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms