Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX3P78415 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX3P78415 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX3P78415 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX3P78415 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX3P78415 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX3P78415 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX3P78415 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX3P78415 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX3P78415 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX3P78415 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX3P78415 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX3P78415 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX3P78415 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX3P78415 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX3P78415 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX3P78415 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX3P78415 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX3P78415 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX3P78415 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX3P78415 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX3P78415 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX3P78415 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX3P78415 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX3P78415 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX3P78415 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX3P78415 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX3P78415 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX3P78415 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX3P78415 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX3P78415 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX3P78415 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX3P78415 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRX3P78415 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRX3P78415 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRX3P78415 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRX3P78415 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
IRX3P78415 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRX3P78415 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
IRX3P78415 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRX3P78415 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRX3P78415 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRX3P78415 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRX3P78415 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRX3P78415 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRX3P78415 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
IRX3P78415 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRX3P78415 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRX3P78415 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRX3P78415 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRX3P78415 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRX3P78415 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
IRX3P78415 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRX3P78415 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRX3P78415 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRX3P78415 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRX3P78415 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRX3P78415 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRX3P78415 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IRX3P78415 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IRX3P78415 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
IRX3P78415 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IRX3P78415 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
IRX3P78415 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IRX3P78415 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IRX3P78415 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IRX3P78415 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IRX3P78415 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IRX3P78415 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRX3P78415 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRX3P78415 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRX3P78415 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRX3P78415 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRX3P78415 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRX3P78415 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRX3P78415 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRX3P78415 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRX3P78415 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRX3P78415 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRX3P78415 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRX3P78415 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRX3P78415 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRX3P78415 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRX3P78415 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRX3P78415 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRX3P78415 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRX3P78415 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRX3P78415 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
IRX3P78415 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRX3P78415 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRX3P78415 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRX3P78415 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRX3P78415 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRX3P78415 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRX3P78415 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRX3P78415 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRX3P78415 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRX3P78415 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRX3P78415 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRX3P78415 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms