Protein–RNA interactions for Protein: P78395

PRAME, Melanoma antigen preferentially expressed in tumors, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEP78395 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PRAMEP78395 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PRAMEP78395 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRAMEP78395 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PRAMEP78395 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PRAMEP78395 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PRAMEP78395 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEP78395 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEP78395 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEP78395 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEP78395 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEP78395 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEP78395 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEP78395 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEP78395 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEP78395 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEP78395 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEP78395 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEP78395 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEP78395 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEP78395 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEP78395 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEP78395 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEP78395 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEP78395 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEP78395 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEP78395 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEP78395 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEP78395 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEP78395 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEP78395 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEP78395 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEP78395 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEP78395 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEP78395 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEP78395 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEP78395 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEP78395 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEP78395 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEP78395 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEP78395 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEP78395 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEP78395 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEP78395 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEP78395 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEP78395 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEP78395 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEP78395 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEP78395 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEP78395 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEP78395 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEP78395 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEP78395 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEP78395 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEP78395 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEP78395 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEP78395 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEP78395 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEP78395 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEP78395 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEP78395 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEP78395 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEP78395 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEP78395 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEP78395 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEP78395 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEP78395 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEP78395 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms