Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPM4P67936 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPM4P67936 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TPM4P67936 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TPM4P67936 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPM4P67936 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPM4P67936 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPM4P67936 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPM4P67936 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPM4P67936 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPM4P67936 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPM4P67936 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPM4P67936 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPM4P67936 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPM4P67936 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPM4P67936 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPM4P67936 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPM4P67936 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPM4P67936 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPM4P67936 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPM4P67936 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPM4P67936 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPM4P67936 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPM4P67936 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPM4P67936 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPM4P67936 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TPM4P67936 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TPM4P67936 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TPM4P67936 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TPM4P67936 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPM4P67936 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPM4P67936 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPM4P67936 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPM4P67936 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPM4P67936 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPM4P67936 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPM4P67936 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPM4P67936 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPM4P67936 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPM4P67936 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPM4P67936 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPM4P67936 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPM4P67936 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPM4P67936 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPM4P67936 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPM4P67936 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPM4P67936 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPM4P67936 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPM4P67936 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPM4P67936 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPM4P67936 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPM4P67936 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPM4P67936 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPM4P67936 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPM4P67936 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPM4P67936 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPM4P67936 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPM4P67936 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPM4P67936 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPM4P67936 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TPM4P67936 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TPM4P67936 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TPM4P67936 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TPM4P67936 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TPM4P67936 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TPM4P67936 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TPM4P67936 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TPM4P67936 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TPM4P67936 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TPM4P67936 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TPM4P67936 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPM4P67936 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TPM4P67936 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPM4P67936 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPM4P67936 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPM4P67936 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPM4P67936 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPM4P67936 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPM4P67936 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPM4P67936 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPM4P67936 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPM4P67936 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPM4P67936 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TPM4P67936 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPM4P67936 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPM4P67936 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPM4P67936 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPM4P67936 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPM4P67936 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPM4P67936 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPM4P67936 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPM4P67936 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPM4P67936 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPM4P67936 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPM4P67936 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPM4P67936 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPM4P67936 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPM4P67936 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPM4P67936 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TPM4P67936 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms