Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKP1P63208 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKP1P63208 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKP1P63208 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKP1P63208 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKP1P63208 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKP1P63208 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKP1P63208 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKP1P63208 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKP1P63208 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKP1P63208 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKP1P63208 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKP1P63208 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKP1P63208 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKP1P63208 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKP1P63208 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKP1P63208 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKP1P63208 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKP1P63208 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKP1P63208 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKP1P63208 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKP1P63208 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKP1P63208 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKP1P63208 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKP1P63208 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKP1P63208 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKP1P63208 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKP1P63208 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SKP1P63208 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKP1P63208 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SKP1P63208 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKP1P63208 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKP1P63208 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKP1P63208 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKP1P63208 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKP1P63208 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKP1P63208 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKP1P63208 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKP1P63208 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKP1P63208 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKP1P63208 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKP1P63208 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKP1P63208 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKP1P63208 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKP1P63208 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKP1P63208 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKP1P63208 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKP1P63208 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKP1P63208 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKP1P63208 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKP1P63208 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKP1P63208 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SKP1P63208 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKP1P63208 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKP1P63208 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKP1P63208 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKP1P63208 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKP1P63208 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKP1P63208 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SKP1P63208 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKP1P63208 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKP1P63208 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKP1P63208 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKP1P63208 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKP1P63208 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKP1P63208 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKP1P63208 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKP1P63208 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SKP1P63208 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKP1P63208 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKP1P63208 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKP1P63208 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKP1P63208 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKP1P63208 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKP1P63208 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKP1P63208 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKP1P63208 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKP1P63208 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKP1P63208 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKP1P63208 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SKP1P63208 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SKP1P63208 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKP1P63208 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKP1P63208 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKP1P63208 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKP1P63208 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKP1P63208 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKP1P63208 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKP1P63208 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKP1P63208 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKP1P63208 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKP1P63208 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SKP1P63208 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKP1P63208 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKP1P63208 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SKP1P63208 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SKP1P63208 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKP1P63208 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SKP1P63208 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SKP1P63208 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms