Protein–RNA interactions for Protein: P63027

VAMP2, Vesicle-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP2P63027 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAMP2P63027 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms