Protein–RNA interactions for Protein: P62760

VSNL1, Visinin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSNL1P62760 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSNL1P62760 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSNL1P62760 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms