Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HERVK_113P62684 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HERVK_113P62684 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
HERVK_113P62684 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HERVK_113P62684 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HERVK_113P62684 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HERVK_113P62684 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HERVK_113P62684 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HERVK_113P62684 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HERVK_113P62684 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HERVK_113P62684 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HERVK_113P62684 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HERVK_113P62684 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HERVK_113P62684 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HERVK_113P62684 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HERVK_113P62684 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HERVK_113P62684 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HERVK_113P62684 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HERVK_113P62684 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HERVK_113P62684 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERVK_113P62684 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERVK_113P62684 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERVK_113P62684 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERVK_113P62684 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERVK_113P62684 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERVK_113P62684 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERVK_113P62684 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERVK_113P62684 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERVK_113P62684 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERVK_113P62684 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERVK_113P62684 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERVK_113P62684 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERVK_113P62684 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERVK_113P62684 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERVK_113P62684 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HERVK_113P62684 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms