Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE2HP62256 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms