Protein–RNA interactions for Protein: P61587

RND3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND3P61587 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RND3P61587 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RND3P61587 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RND3P61587 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RND3P61587 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RND3P61587 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RND3P61587 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RND3P61587 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RND3P61587 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RND3P61587 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RND3P61587 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RND3P61587 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RND3P61587 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RND3P61587 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RND3P61587 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RND3P61587 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RND3P61587 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RND3P61587 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RND3P61587 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RND3P61587 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RND3P61587 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RND3P61587 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RND3P61587 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RND3P61587 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RND3P61587 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RND3P61587 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RND3P61587 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RND3P61587 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RND3P61587 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RND3P61587 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RND3P61587 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RND3P61587 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RND3P61587 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RND3P61587 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RND3P61587 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RND3P61587 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RND3P61587 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RND3P61587 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RND3P61587 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RND3P61587 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RND3P61587 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RND3P61587 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RND3P61587 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RND3P61587 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RND3P61587 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RND3P61587 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RND3P61587 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RND3P61587 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RND3P61587 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RND3P61587 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RND3P61587 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RND3P61587 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RND3P61587 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RND3P61587 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RND3P61587 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RND3P61587 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RND3P61587 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RND3P61587 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RND3P61587 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RND3P61587 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RND3P61587 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RND3P61587 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RND3P61587 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RND3P61587 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RND3P61587 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RND3P61587 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RND3P61587 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RND3P61587 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RND3P61587 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RND3P61587 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RND3P61587 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RND3P61587 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RND3P61587 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RND3P61587 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RND3P61587 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RND3P61587 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RND3P61587 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RND3P61587 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RND3P61587 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RND3P61587 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RND3P61587 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RND3P61587 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RND3P61587 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RND3P61587 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RND3P61587 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RND3P61587 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RND3P61587 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RND3P61587 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RND3P61587 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RND3P61587 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RND3P61587 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RND3P61587 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RND3P61587 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RND3P61587 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RND3P61587 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RND3P61587 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RND3P61587 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RND3P61587 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RND3P61587 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RND3P61587 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms